Establecimos un modelo de NHP prometedor abordando lo siguiente: 1) variabilidad genética e inmunológica en subespecies, 2) dosis de inóculo, 3) ruta de inóculo, 4) cepa virulenta de virus aislada del paciente y 5) antecedentes demográficos de primates, que podrían investigar la interacción entre el SARS-CoV-2 y un sistema inmunológico similar de los seres humanos. Expusimos a los macacos a altos títulos de SARS-CoV-2 por vía intratraqueal, oral, conjuntival, intranasal e intravenosa. Todos los macacos tuvieron neumonía intersticial aguda con endotelitis pulmonar y una pérdida significativa de linfocitos totales. Después de las inoculaciones virales, todos los animales vivos se sometieron a muestreo de tejidos nasofaríngeos, orofaríngeos, conjuntivales y rectales. Todos los macacos fueron sacrificados 3 días después de la infección. Tras la necropsia, se examinaron muestras de los órganos respiratorios, inmunitarios, intestinales, cardiovasculares y reproductivos. El examen post-mortem mostró lesiones multifocales de color rojo brillante en los lóbulos superior, medio e inferior de los pulmones. Las vías respiratorias superiores e inferiores fueron los sitios predominantes de replicación del virus. En la mayoría de los demás órganos se encontraron niveles virales bajos y no se detectaron en el plasma en ningún momento. Todos los macacos tuvieron una pérdida significativa de linfocitos totales, incluidas las células T CD4 + y CD8 +, las células B y las células NK durante la infección temprana. De manera similar, se notificó linfopenia en el 83,2% de los pacientes hospitalizados con SARS-CoV-2. De tal forma, la alteración de linfocitos periféricos parece estar correlacionada con casos clínicos graves.